رئیس شورای حوزه علمیه تهران گفت: رهبر جدید انقلاب «مجتهدی است زبده» و مسلط بر مبانی استنباط.

آیت‌الله پیشنمازی گفت: راهبردهای امام شهید برای همیشه دشمنان را ناامید می‌کند.

آیت الله صادق آملی‌لاریجانی انتخاب سومین رهبر جمهوری اسلامی ایران را تبریک گفت.

آیت‌الله اعرافی مدیر حوزه‌های علمیه در پیامی انتخاب آیت‌الله سید مجتبی خامنه‌ای به رهبری را تبریک گفت.

دبیرکل مجمع جهانی اهل‌بیت(ع) گفت: آیت‌الله مجتبی خامنه‌ای دارای ویژگی‌های برجسته علمی، معنوی و شخصیتی است.

آیت‌الله اراکی گفت: بیعت با آیت‌الله سیدمجتبی خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب را بیعت با امام زمان (عج) می‌دانیم.

حضرت آیت الله سبحانی در پیامی به اعضای مجلس خبرگان ابراز امیدواری کردند: رهبر منتخب، در خدمت به شریعت، دیانت و کشور موفق و مؤید باشند.

آیت‌الله محمدجواد فاضل‌لنکرانی در پیامی انتخاب آیت الله سیدمجتبی خامنه‌ای به رهبری انقلاب اسلامی را تبریک گفت.

آیت‌الله عبدالله جوادی آملی با اشاره به معرفی آیت‌الله سیدمجتبی حسینی خامنه‌ای ‌به عنوان رهبر جدید انقلاب توسط مجلس خبرگان رهبری در پیامی گفت: نظام امامت و امت از بهترین ره آوردهای وحیانی است

آیت‌الله مکارم شیرازی در پی انتخاب آیت الله سید مجتبی خامنه‌ای پیامی صادر کرد.